• مقدمه (12)
  • تعریف مسئله (13)
  • اهمیت موضوع (16)
  • چالش‌ها (18)
  • اهداف پژوهش (21)
  • ساختار پایان‌نامه (22)
• مفاهیم اولیه (24)
  • جمع‌آوری داده (25)
    • ‌ساخت اسمایل‌ها (25)
    • ک‌راس (26)
    • تبدیل اسمایل به ساختار سه‌بعدی (29)
    • محاسبه افینیتی (31)
    • کنترل کیفیت (32)
  • یادگیری عمیق (32)
    • تعریف (33)
    • بررسی اجمالی (33)
    • یادگیری در پیش‌بینی افینیتی دارو-هدف (34)
    • یادگیری ماشین (35)
    • یادگیری عمیق (36)
• کارهای پیشین (38)
  • مدل های مبتنی بر یادگیری ماشین (38)
    • RLS Kronecker (39)
    • SimBoost (40)
  • مدل های مبتنی بر یادگیری عمیق (41)
    • DeepDTA (41)
    • WideDTA (43)
    • GraphDTA (45)
    • AttentionDTA (52)
    • GANsDTA (56)
• مدل پیشنهادی (60)
  • ChemBERTa (61)
  • تنظیم دقیق (66)
  • تنظیمات (68)
• نتایج (71)
  • متریک‌های ارزیابی (71)
  • ساختار پیشنهادی (74)
  • نتایج نهایی (75)
  • جمع‌بندی (76)
  • کارهای آتی (78)
• مراجع (79)
• واژه‌نامه (88)