• فهرست شکل‌ها (8)
• فهرست جدول‌ها (10)
• مقدمه (12)
  • بیان مسئله (14)
  • اهمیت موضوع (15)
  • چالش‌ها (16)
  • کلیات راهکار پیشنهادی (16)
  • جمع‌بندی (17)
• مروری بر ادبیات و پیشینه‌ی علمی (18)
  • مروری بر پیشینه‌ی علمی (18)
    • مغز (18)
    • مطالعات مغز (19)
    • تصویربرداری مغزی (21)
    • تصویربرداری تشدید مغناطیسی عملکردی (25)
    • اختلالات عصبی (29)
    • نظریه‌ی شبکه (32)
    • خواص گراف مغزی (38)
    • مشکلات گراف (38)
    • مدل تهی (39)
    • نظریه‌ی گراف در علوم اعصاب (39)
    • تعاریف و مفاهیم در نظریه‌ی اطلاعات و فیزیک کوانتوم (41)
    • آنتروپی گراف (47)
  • کارهای پیشین (50)
    • داده‌ها (50)
    • پیش‌پردازش داده‌های تصویربرداری مغزی (51)
    • تعریف گراف مغزی (51)
    • نتایج و روند پژوهش‌های پیشین (56)
    • معیارهای تحلیل شبکه (61)
  • جمع‌بندی (67)
• روش پیشنهادی (70)
  • مجموعه دادگان و مراحل پیش‌پردازش (72)
  • ساخت گراف (75)
  • شیوه‌ی تحلیل (76)
  • جمع‌بندی (82)
• تحلیل نتایج پیاده‌سازی (84)
  • تحلیل آماری مجموعه دادگان (84)
  • تحلیل شبکه‌ی تک‌لایه (85)
  • تحلیل شبکه‌ی چندلایه (88)
  • جمع‌بندی (96)
• نتیجه‌گیری و کارهای آتی (98)
• مراجع (100)
• واژه‌نامه انگلیسی به فارسی (108)
• واژه‌نامه فارسی به انگلیسی (115)