• فهرست شکل‌ها (8)
• فهرست جدول‌ها (9)
• مقدمه (10)
  • تعریف مسئله (11)
  • اهمیت (14)
  • چالش‌ها (16)
  • ‌ساختار پایان‌نامه (18)
• مفاهیم‌ زیست‌شناسی و روش‌های اندازه‌گیری بیان ژن (20)
  • مفاهیم زیست‌شناسی (20)
    • سلول (20)
    • چرخه سلولی (22)
    • تمایز سلولی (25)
    • کرومزوم (26)
    • مولکول DNA (27)
    • ژن (28)
    • مولکول mRNA (28)
    • بیان ژن (29)
    • پروتئين (29)
    • هورمون (30)
  • بیماری دیابت (31)
    • سلول بتا (31)
    • انسولین (33)
    • تولید و ترشح انسولین (35)
    • بیماری دیابت (37)
  • روش‌های اندازه‌گیری بیان ژن (41)
    • تکنولوژی ریزآرایه (41)
    • روش توالی‌یابی RNA (45)
    • مقایسه روش‌های اندازه‌گیری بیان ژن (46)
• مروری بر پژوهش‌های پیشین (48)
  • پژوهشهاي پيشين مرتبط با ايده حل مسئله (48)
  • جمع‌بندی (55)
• روش پژوهش (56)
  • روش مبتنی بر قرار دادن دادگان تکنولوژی‌های ریزآرایه و توالی‌یابی RNA در کنار یکدیگر (61)
    • همگون‌سازی داده‌ها (61)
    • نرمال‌سازی داده (64)
    • از بین بردن اثر دسته‌ای (69)
    • تحلیل مولفه‌های اصلی (70)
    • بررسی تغییرات چندبرابری بیان ژن‌ها (71)
    • ترسیم شبکه تنظیم‌کننده ژنی (72)
    • مدلسازی و کشف الگوی رفتاری ژن‌ها (73)
  • روش مبتنی بر بررسی جداگانه دادگان تکنولوژی‌های ریزآرایه و توالی‌یابی RNA درنظر گرفتن دیگری (74)
    • مدلسازی و کشف الگوی رفتاری ژن‌ها (74)
  • جمع‌بندی (79)
• شبیه‌سازی و نتایج (80)
  • معرفی ‌دادگان (80)
    • معرفی میکروآرایه‌ها (80)
    • معرفی ماشین‌های توالی‌یابی (81)
    • مجموعه دادگان مورد استفاده (81)
  • معرفی معیار‌های ارزیابی (83)
    • میانگین مربعات خطا (84)
    • یافتن ژن‌های با بیان متفاوت (84)
  • پیش‌پردازش دادگان هر آزمایش (85)
    • پیش‌پردازش دادگان ریزآرایه (85)
    • پیش‌پردازش دادگان توالی‌یابی RNA (87)
    • نرمال‌سازی (87)
  • روش پیشنهادی متناسب با فرضیه اول (88)
    • از بین بردن اثر دسته‌ای (89)
    • بررسی تغییرات چندبرابری بیان ژن‌ها (90)
  • روش پیشنهادی متناسب با فرضیه دوم (94)
    • از بین بردن اثر دسته‌ای (95)
    • مدلسازی (96)
  • ‌جمع‌بندی (102)
• جمع‌بندی و کارهای آتی (104)
  • دستاورد‌ها (105)
  • کارهای آینده (105)
• مراجع (105)
• واژه‌نامه انگلیسی به فارسی (114)
• واژه‌نامه فارسی به انگلیسی (117)