• چکیده (4)
• کلیدواژه (4)
• فهرست (5)
• فهرست شکل‌ها (8)
• فصل 1 مقدمه (10)
  • 1-1 طیف ارتعاشی (10)
  • 2-1 مولکول کایرال و طیف VCD (10)
  • 3-1 دینامیک مولکولی (15)
    • 1-3-1 تفاوت محاسبات استاتیکی و شبیه‌سازی دینامیکی (15)
    • 2-3-1 طیف سنجی دینامیکی و تفاوت آن با طیف سنجی استاتیکی (18)
  • 4-1 افزایش سرعت در انجام محاسبات دینامیک مولکولی (21)
• فصل 2 تئوری (23)
  • 1-2 فرمولاسیون دینامیک مولکولی (23)
    • 1-1-2 دما (23)
    • 2-1-2 ترموستات (24)
    • 3-1-2 دینامیک مولکولی آغازین (AIMD) (26)
    • 4-1-2 تقریب بورن-اوپنهایمر و فرمولاسیون BOMD (27)
    • 5-1-2 فرمولاسیون ارنفست (30)
    • 6-1-2 رویکرد کار-پارینلو و فرمولاسیون CPMD (33)
  • 2-2 محاسبه‌ی طیف IR و VCD با استفاده از روش‌های محاسباتی (35)
  • 3-2 تئوری VCD (38)
• فصل 3 محاسبات (41)
  • 1-3 مقدمه (41)
    • 1-1-3 سطح تئوری انتخاب شده برای AIMD (41)
  • 2-3 انجام محاسبات AIMD (44)
    • 1-2-3 زمان کلی شبیه‌سازی (44)
    • 2-2-3 زمان گام‌های زمانی (44)
    • 3-2-3 نوع ترموستات مورد استفاده (46)
    • 4-2-3 پارامترهای DFT (47)
    • 5-2-3 سرعت اولیه (52)
  • 3-3 بدست آوردن طیف IR (53)
    • 1-3-3 بدست آوردن طیف IR به روش استاتیکی (53)
    • 2-3-3 استفاده از توابع خودهم‌بستگی (55)
    • 3-3-3 بدست آوردن ممان دوقطبی (56)
  • 4-3 بدست آوردن طیف VCD (60)
    • 1-4-3 استفاده از توابع هم‌بستگی متقابل (61)
    • 2-4-3 محاسبه‌ی دانسیته‌ی الکترونی (61)
      • 1-2-4-3 فایل CUBE (61)
      • 2-2-4-3 استفاده از ماژول DENSF (62)
      • 3-2-4-3 استفاده از ماژول NAO (62)
      • 4-2-4-3 خلاصه سازی فایل‌های Cube در BQB (64)
    • 3-4-3 بدست آوردن ممان مغناطیسی (65)
  • 5-3 استفاده از نرم‌افزار TRAVIS برای محاسبه طیف IR و VCD (68)
    • 1-5-3 محدودیت‌های نرم افزار TRAVIS (69)
• نتیجه گیری (71)
• منابع و مأخذ (73)
• Abstract (79)
• Keywords (79)